Francisca Núñez estudió Licenciatura en Artes con mención en Escultura en la Universidad de Chile. Fue galardonada con el Premio Altazor de las Artes Nacionales en la categoría Escultura en 2007.

Durante la década de 1980 participó en espacios colectivos y experimentales como el Taller de Artes Visuales (TAV), el Taller Chucre Manzur y el Taller 619. Aunque desarrolló principalmente una práctica escultórica, también incursionó en la pintura, el dibujo, el grabado y el textil.

En 1989 se radicó en Europa y realizó estudios de posgrado en la Rijksakademie van Beeldende Kunsten de Ámsterdam. De regreso en Chile en 2005, participó en exposiciones en instituciones como el Museo Nacional de Bellas Artes, el Centro Cultural La Moneda y Matucana 100.

Su obra se caracterizó por el uso del color y la experimentación con materiales como madera, cartón, plumavit y textiles, abordando temas vinculados a la vida rural, la imaginería popular, los roles de género y la maternidad.

Francisca Núñez falleció en diciembre de 2024 en Laguna Verde, Chile.